po roce 1989 bylo letiště v majetku státu,
v polovině roku 2002 začala provoz letiště zajišťovat soukromá společnost LETIŠTĚ BRNO, a.s.,
v roce 2004 předal stát letiště do majetku Jihomoravského kraje,
od 10. listopadu 2017 má akciová společnost pronajímající si Letiště Brno nového majitele, a to firmu Accolade Holding, (původní majitel B.A.W.D.F. byl touto společností odkoupen)

Vzletová a přistávací dráha byla v roce 1978 prodloužena z 2000 m na 2650 m. V roce 1982 bylo letiště předáno armádě a pravidelná přeprava osob ustala.
V roce 1989 bylo letiště v majetku státu a nadále ve správě ministerstva obrany, vojenský provoz zde byl ukončen roku 1991. Od roku 1992 převzala jeho správu Česká správa letišť a v srpnu 1992 došlo k obnovení mezinárodního civilního provozu na letišti.

Středisko letových navigačních služeb s řídící věží má tvar kornoutu. (Stejnou koncepci autoři použili také na letišti Olšová Vrata v Karlových Varech.) Prosklená klimatizovaná a odhlučněná část věže - pracoviště leteckých dispečerů - na půdorysu šestnáctiúhelníku umožňuje jak zaclonění, tak nerušený výhled.
Terminál, připomínající plochou bublinu umožňuje další rozšiřování v závislosti na zájmu o leteckou dopravu do Brna. Petr Parolek z brněnského ateliéru Parolli pro něj zvolil jako hlavní materiál kov a sklo. (Realizace: 2001, Investor: Řízení letového provozu ČR, s. p., Projekt: Jan Němec, Zdeněk Žilka - Němec a Žilka architekti, AR18.)

V letech 2005–2006 byla postavena nová odbavovací hala od architekta Petra Parolka, která byla otevřena v září 2006.

V letech 2008–2009 byla přestavěna a modernizována stávající (příletová) hala.