Práce Milana Sekaniny zasahují do mnoha oblastí matematiky. Nejvýznamnějších výsledků dosáhl v algebře, teorii grafů, teorii uspořádaných množin a topologii. Byl autorem 11 učebnic a skript, včetně středoškolských učebnic geometrie.

Vysokoškolské práce:
- Decompositions in Euclidean spaces (1958)

Dílo:
- Mnohostěny (1973)
- Základní pojmy z geometrie pro 1. ročník gymnasií se zaměřením na matematiku (1974)
- Základní pojmy z teorie kategorií (1974)
- Vybrané partie z geometrie (1978)
- Vektorové prostory a elementární geometrie pro 2. ročník gymnázií se zaměřením na matematiku (1979)
- Vybrané kapitoly z elementární geometrie (1979)
- Světová hospodářská krize (1929–⁠1933) na Ostravsku (1982)
- Vybrané partie z geometrie zobrazení v prostoru pro 3. ročník gymnázií se zaměřením na matematiku (1983)
- Dělnické hnutí na Ostravsku v období světové hospodářské krize 1929–⁠1933 (1983)
- Vybrané kapitoly z kombinatoriky a teorie grafů (1987)
- Kdy nám bylo nejhůře? (2004)